Nombre del mentor/a: Dr. Alexandra Hiller
Enlace a la página del laboratorio: https://stri.si.edu/scientist/harilaos-lessios
Co-mentor(es/as): Dr. Harilaos Lessios
Ubicación de la pasantía:
Trabajo molecular y morfológico: Naos Facilities
Muestreo: diversas localidades y ecosistemas del Pacífico y Caribe panameño
Resumen del proyecto
A pesar de la importancia de los cangrejos marinos (Decapoda: Anomura and Brachyura) desde una perspectiva ecológica, biogeográfica y evolutiva, los estudios sobre su diversidad en el litoral de Panamá son escasos, especialmente aquellos que brinden claves confiables de identificación de los taxa. Este proyecto pretende combinar Taxonomía Asistida por Computación (CAT por sus siglas en inglés) y barcoding de ADN para documentar la diversidad de cangrejos marinos presentes en aguas panameñas. Los estudiantes serán entrenados en taxonomía integral (taxonomía clásica, asistida por computación y molecular), así como en métodos de campo, de laboratorio, analíticos y de ilustración científica. Especímenes de cangrejos marinos serán muestreados en diferentes localidades y ecosistemas (e.g. intermareal rocoso, arrecifes coralinos, raíces de mangle) del Caribe y Pacífico panameños. Los cangrejos serán documentados a través de fotografía e ilustración científica, serán preservados para identificación taxonómica, depositados en colecciones de referencia y parcialmente disectados para aislamiento de ADN. La información taxonómica será compilada en una matriz de datos, la cual alimentará el software de la clave interactiva taxonómica CAT. Esta clave específica estará disponible para la comunidad científica interesada en una identificación confiable de las especies, y servirá como punto de referencia de la diversidad actual de diferentes ecosistemas marinos de Panamá. Este enfoque morfológico será soportado por la técnica de barcoding, un método eficiente para confirmar la identificación de especies, el cual consiste en la comparación de secuencias de ADN de un fragmento del gen mitocondrial COI. Se dará especial énfasis a complejos de especies y taxa taxonómicamente difíciles. Las secuencias serán depositadas en GenBank para futuras identificaciones y para estudios de filogenia y genética de poblaciones.
Habilidades requeridas
Los estudiantes trabajarán bajo condiciones demandantes porque la colecta de cangrejos en el intermareal rocoso implica caminar sobre rocas lisas. El careteo para colectar especies del submareal requiere de habilidades para nadar en áreas rocosas expuestas a oleaje y corrientes fuertes. La manipulación de los cangrejos y la documentación de su diversidad requieren de paciencia y pasión por estudiar su biología. Varias horas de trabajo computacional, ilustración científica y revisión de claves taxonómicas son requeridas. Interés en biología evolutiva y experiencia en trabajo molecular son deseables, pero no obligatorios.