Puente a la Ciencia:
Programa de
Pasantías

Proyecto: Genómica comparada de poblaciones y especiación en peces eléctricos neotropicales

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Nombre del mentor/a: Carlos F.  Arias

Enlace a la página del laboratorio: https://striresearch.si.edu/gamboa-heliconius/

Co-mentor(es/as): Owen McMillan

Ubicación de la pasantía: Gamboa, Ecological and Evolutionary Genomics Lab.

 

Resumen del proyecto

Uno de los temas fundamentales en biología evolutiva es comprender cómo la interacción entre la selección natural, la deriva genética y el flujo génico da lugar a nueva variación genética. En este contexto, el estudio del papel del entorno geográfico en la especiación ha cobrado un renovado interés, especialmente en lo que respecta a sus efectos sobre la diferenciación genómica y la arquitectura genética en la generación de nuevas formas de vida.

A pesar de los avances teóricos en este campo, aún existen pocas investigaciones empíricas que exploren cómo evoluciona el genoma durante la adaptación y la especiación, particularmente en escenarios de colonización reciente. Este proyecto busca llenar ese vacío mediante el análisis comparativo del genoma de tres especies de peces eléctricos neotropicales, utilizando tecnologías de secuenciación de última generación, como Oxford Nanopore e Illumina, junto con herramientas bioinformáticas avanzadas.

El estudiante adquirirá experiencia en técnicas clave de biología molecular y aprenderá a manejar flujos de trabajo (“pipelines”) para el análisis de datos de genómica comparativa. Los resultados de este estudio contribuirán a una mejor comprensión de los procesos evolutivos que generan diversidad biológica, explorando la interacción de fuerzas evolutivas a distintas escalas temporales y espaciales.

 

Habilidades requeridas

Preferiblemente algo de conocimientos en Bioinformática, Bash y R.
Algo de conocimiento en Técnicas moleculares.

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